Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms