Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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