Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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GABRA6Q16445 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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GABRA6Q16445 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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GABRA6Q16445 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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GABRA6Q16445 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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GABRA6Q16445 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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