Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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