Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms