Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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