Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms