Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms