Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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