Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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