Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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