Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNAB1Q14722 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms