Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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SSPNQ14714 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SSPNQ14714 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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