Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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