Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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