Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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