Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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