Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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