Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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