Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCGQ13326 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCGQ13326 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCGQ13326 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCGQ13326 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCGQ13326 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCGQ13326 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SGCGQ13326 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SGCGQ13326 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SGCGQ13326 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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