Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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