Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CALCOCO2Q13137 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CALCOCO2Q13137 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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