Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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