Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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CSTF3Q12996 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CSTF3Q12996 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CSTF3Q12996 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CSTF3Q12996 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CSTF3Q12996 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CSTF3Q12996 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CSTF3Q12996 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CSTF3Q12996 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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CSTF3Q12996 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CSTF3Q12996 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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