Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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