Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms