Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms