Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms