Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LTBQ06643 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LTBQ06643 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LTBQ06643 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LTBQ06643 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LTBQ06643 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LTBQ06643 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LTBQ06643 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LTBQ06643 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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LTBQ06643 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LTBQ06643 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LTBQ06643 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTBQ06643 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LTBQ06643 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LTBQ06643 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LTBQ06643 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LTBQ06643 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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LTBQ06643 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LTBQ06643 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LTBQ06643 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LTBQ06643 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LTBQ06643 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LTBQ06643 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LTBQ06643 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LTBQ06643 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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