Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms