Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AP002761.2-201ENST00000541254 618 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 TBC1D3P4-201ENST00000338790 1075 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC006460.1-201ENST00000421437 808 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AL360169.2-201ENST00000619713 561 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC106733.1-201ENST00000624476 1038 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 IL25-202ENST00000397242 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms