Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms