Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms