Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 445.4 ms