Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms