Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms