Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms