Protein–RNA interactions for Protein: P82251

SLC7A9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A9P82251 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC7A9P82251 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC7A9P82251 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms