Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms