Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAP25P60880 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms