Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTBP2P56545 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTBP2P56545 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms