Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23BP54727 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms