Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms