Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGDP52209 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGDP52209 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGDP52209 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms