Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms