Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms