Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms