Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A1P43005 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms