Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PI4KAP42356 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms