Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPOP42166 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPOP42166 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPOP42166 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPOP42166 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms